10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02552 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  44.98 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  45.09 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  38.74 
 
 		 340 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  46 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5036  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484902  normal  0.704388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  35.12 
 
 		 177 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 		 176 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.35 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  35.37 
 
 		 189 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>