80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3115 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.82 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  88.46 
 
 		 162 aa  278  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  73.05 
 
 		 172 aa  242  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  77.4 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.7 
 
 		 171 aa  235  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.05 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  74.66 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  74.55 
 
 		 170 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  77.71 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.52 
 
 		 167 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  66.88 
 
 		 169 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  71.61 
 
 		 165 aa  222  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  69.48 
 
 		 167 aa  219  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.53 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  71.43 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  68.49 
 
 		 160 aa  216  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.75 
 
 		 180 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  70.75 
 
 		 182 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  70.55 
 
 		 168 aa  213  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 169 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  41.27 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.88 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  32.47 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  38.32 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  37.84 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  36.96 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  30.11 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  37.29 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  35.59 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  35.59 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  35.59 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  27.27 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  26.26 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  35.64 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  41.07 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  34.95 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  35.64 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  34.65 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  34.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  25.66 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  30.12 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 182 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  30.12 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  25.37 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>