33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2772 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  357  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.28 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  41.23 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  40.65 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  40.19 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  39.25 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  40.19 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.12 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  36.45 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  36.45 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.38 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.77 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  39.64 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  39.77 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  38.32 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  38.32 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  34.35 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  30.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  41.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  41.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  41.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  41.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.43 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  27.4 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  40.62 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>