48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5642 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  314  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  60.34 
 
 		 206 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.64 
 
 		 169 aa  187  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.11 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.32 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  43.09 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.97 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 172 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  41.86 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  40.48 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.4 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  42.52 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  39.16 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.27 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.48 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  39.68 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  44.17 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  41.6 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  30.57 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  31.36 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  33.66 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  29.27 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.23 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  27.97 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  32.38 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  28.71 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  32.65 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  26.36 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7641  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  28.04 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>