57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3615 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.45 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.15 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  57.36 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.46 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  57.58 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.72 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  56.3 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.59 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  54.2 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  54.2 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  48.09 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  48.09 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  55.83 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  40.32 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.31 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  43.2 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  39.67 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  30.63 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  27.93 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  27.5 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  29.92 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  28 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  35.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  35.21 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  35.21 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  35.21 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 172 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 163 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  37.68 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>