49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0396 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  88.97 
 
 		 145 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.77 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  69.77 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.99 
 
 		 137 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.04 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  66.17 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.58 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  57.69 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  57.69 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  52.59 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  55.04 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  55.04 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  62.9 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  45.38 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.09 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  41.41 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  42.86 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  34.81 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  34.86 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.51 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  35.09 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  37.78 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  35.29 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  34.07 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 149 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>