16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5434 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
135 aa  269  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  28.38 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  30.34 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2985  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171008  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  32.47 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  32.53 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  32.29 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>