17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2985 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2985  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
142 aa  286  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171008  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  42.65 
 
 
149 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3504  cyclic nucleotide-binding protein  31.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 
104 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
662 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
372 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  31.82 
 
 
172 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>