65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6771 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  42.39 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  36.59 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  34.71 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  34.71 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  34.71 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  34.3 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  33.88 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  35.48 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  36.14 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  34 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.86 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  32.54 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  31.45 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  32.67 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  29.53 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  30.13 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  32.53 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  33.6 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  34 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  31.87 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  31.6 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  31.6 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  30.2 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  30.8 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  31.75 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  31.45 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  30.52 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  30.12 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  29.37 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  32.4 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  28.69 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  31.35 
 
 		 289 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  29.72 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  31.2 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  31.6 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  31.75 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  30.95 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  30.4 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  30.4 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  30.95 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  30.95 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  30.95 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  30.28 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.22 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  28.29 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>