34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  53.73 
 
 		 202 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.08 
 
 		 186 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  53.08 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.49 
 
 		 175 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  52.31 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  51.94 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  47.06 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  48.84 
 
 		 190 aa  144  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  48.84 
 
 		 190 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  49.18 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.94 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  42.15 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  36.15 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  45.71 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  42.15 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  37.9 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 133 aa  93.6  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  38.1 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  40.18 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  35.19 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.91 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0888  mannose-1-phosphate guanylyltransferase-like  27.91 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  hitchhiker  0.000147914 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 118 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2283  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.76 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.97 
 
 		 477 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 148 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>