81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4505 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  75.2 
 
 		 134 aa  202  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  72.18 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  57.39 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.38 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4585  hypothetical protein  67.24 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5303  hypothetical protein  73.91 
 
 		 57 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  36.61 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  45.21 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  32.08 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.43 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5010  hypothetical protein  78.79 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4921  hypothetical protein  78.79 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  39.13 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  38.04 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  39.56 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  36.96 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  39.56 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  35.11 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  35.56 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  37.8 
 
 		 318 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.91 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  34.48 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  34.41 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  34.41 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  32.17 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  32.61 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  36.99 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  32.98 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  33.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  37.68 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  35.19 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  34.21 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  33.7 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.51 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.36 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.36 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  37.08 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.19 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  28.7 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  29.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.11 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.97 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  38.57 
 
 		 127 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>