87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2920 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  78.22 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  63.85 
 
 
135 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.28 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.52 
 
 
139 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  61.42 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  61.42 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  60.63 
 
 
134 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  68.32 
 
 
134 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  67.62 
 
 
134 aa  147  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  51.2 
 
 
157 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 
129 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  68.82 
 
 
133 aa  139  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.13 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  52.99 
 
 
134 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  53.33 
 
 
135 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  44.63 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
133 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  38.46 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.02 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  39.42 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  39.42 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  40.86 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  40.86 
 
 
318 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  40.86 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  39.8 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  36.54 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  40 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  41.94 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  38.24 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  38 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.38 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  41.94 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.9 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  38.46 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  40.86 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  38.66 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  38.68 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  38.38 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  39.08 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  32.76 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.03 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.77 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  27.56 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 
173 aa  53.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  36.47 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30.11 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.33 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3569  hypothetical protein  34.51 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  29.71 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  27.13 
 
 
143 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  24.78 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 
231 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  29.67 
 
 
129 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  37.97 
 
 
202 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>