97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5430 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  65.47 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  73.83 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  75.47 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  72.64 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  71.7 
 
 		 135 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.91 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  57.55 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  61.42 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  61.42 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  69.52 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  69.52 
 
 		 134 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  59.63 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.11 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.47 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  58.88 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  41.53 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  41.32 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  39.45 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.84 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.94 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.35 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  40.4 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  42.31 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  36.79 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  35.11 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  38.89 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  36.21 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  37.23 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  37.23 
 
 		 318 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  36.27 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  39 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  37.11 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  39.77 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  29.71 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 171 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  36.84 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  31.47 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.54 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  28.79 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.66 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30.43 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  30.43 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.69 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  25.38 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  32.95 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.73 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  36.92 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  35.38 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  33.77 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  27.59 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  35 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  35 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  30.77 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>