68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2789 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  78.01 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.61 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80 
 
 		 138 aa  199  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.57 
 
 		 138 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  63.7 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.36 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  63.12 
 
 		 137 aa  169  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  73.58 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.09 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  57.86 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.55 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.55 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.55 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  53.19 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.07 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  58.33 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  54.47 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  57.41 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  56.73 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  54.72 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  57 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.25 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  55.1 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  43.31 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  40.5 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.86 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  41.84 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  43.75 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  43.75 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  40.83 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  36.17 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  36.72 
 
 		 318 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  39.09 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  37.27 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  35.94 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.11 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  38.38 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  37.29 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  37.27 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  36.7 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  35.92 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  36.96 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  37.5 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.03 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.25 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.06 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 178 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  29.01 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  34.55 
 
 		 135 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>