70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4739 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.64 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  65.19 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  65.93 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  77.57 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  66.17 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.69 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  68.18 
 
 		 137 aa  169  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.07 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.42 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.41 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.32 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.32 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  52.27 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  54.4 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.13 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  57 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  51.22 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.23 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  55 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  49.57 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  49.17 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.4 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  46.46 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 179 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  41.35 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.35 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  40.32 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  42.61 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.4 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  42.98 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  43.93 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  38.58 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  42.11 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  37.72 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  42.27 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  38.21 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  38.21 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  42.27 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  41.3 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  38.1 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.27 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  39.18 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  38.38 
 
 		 171 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  40.21 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.64 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  36.54 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  33.71 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  31.86 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>