24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3091 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.63 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.75 
 
 
144 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  35.71 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  40.58 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  40.58 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  40.58 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  36.84 
 
 
152 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  40 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  37.5 
 
 
150 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  36.62 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  31.17 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
141 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  32 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  32.05 
 
 
138 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>