73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4674 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.36 
 
 		 137 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  63.77 
 
 		 138 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.17 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.36 
 
 		 138 aa  172  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  65.93 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.42 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  73.58 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.03 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  62.41 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  59.29 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.87 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.87 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.99 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.99 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  53.03 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  56.9 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  57.41 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  58.42 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  56.73 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  55.24 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  56.19 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  44.6 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  49.57 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.65 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  39.66 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  43.31 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  42.74 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  39.5 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.09 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  41.51 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  39.62 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  34.96 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  39.34 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  39.56 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  38.46 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  43.18 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  41.05 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  39 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  38.04 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  38.68 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  38.05 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  38.04 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  39.6 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  33.04 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  35.25 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  44.26 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.6 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  30.83 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  33.77 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>