83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0195 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  99.35 
 
 		 155 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  97.89 
 
 		 150 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  90.6 
 
 		 152 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  48.44 
 
 		 146 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  49.23 
 
 		 140 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 		 139 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 		 139 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  55.77 
 
 		 139 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  52.29 
 
 		 141 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  46.94 
 
 		 150 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 133 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  48.57 
 
 		 133 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  49.04 
 
 		 145 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.11 
 
 		 139 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.7 
 
 		 139 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  46.73 
 
 		 138 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  46.02 
 
 		 138 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 147 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 138 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  41.22 
 
 		 137 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  41.94 
 
 		 134 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  42.03 
 
 		 138 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  45.16 
 
 		 133 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  36.62 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  44.54 
 
 		 138 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  40.86 
 
 		 131 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  40.86 
 
 		 134 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  40.86 
 
 		 131 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.24 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  40.86 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.55 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  40.86 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.27 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.23 
 
 		 139 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 		 135 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  37.21 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  39.45 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.27 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  37.6 
 
 		 141 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.27 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.38 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.68 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  40 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.67 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  31.4 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  35.16 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 133 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.71 
 
 		 133 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 173 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 135 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 145 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 140 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.62 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  30.49 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1370  hypothetical protein  53.92 
 
 		 696 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  27.12 
 
 		 132 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 178 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>