53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5062 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  61.9 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  59.26 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  56.88 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  53.7 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4585  hypothetical protein  58.62 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  43.04 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  41.77 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  42.68 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  40.51 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.53 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.08 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  36.26 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.56 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.08 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  35.16 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  36.17 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5303  hypothetical protein  48.94 
 
 		 57 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  33.71 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  26.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.24 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  33.71 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.9 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  39.44 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 178 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.77 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.77 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>