78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3253 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
139 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  97.84 
 
 
139 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  97.84 
 
 
139 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  92.92 
 
 
141 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  74.45 
 
 
140 aa  205  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  51.06 
 
 
146 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  53.39 
 
 
318 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  56.03 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  52.99 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  48.39 
 
 
133 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  46.56 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  48.09 
 
 
138 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  55.14 
 
 
150 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  52.43 
 
 
138 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  49.59 
 
 
138 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.51 
 
 
139 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.29 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  43.26 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  44.66 
 
 
150 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  47.57 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  46.36 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  38.17 
 
 
135 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 
144 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  38.46 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  42.54 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  39.09 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  40.31 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  39.46 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  33.83 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  40 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  34.71 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.09 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  40.31 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  34.15 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.19 
 
 
172 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.98 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.96 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.73 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  48.24 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  40.86 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.4 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  33.59 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  30.23 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  32.54 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  36.47 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.35 
 
 
231 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  28.7 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  39.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.57 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  25.19 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  42.37 
 
 
136 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  33 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>