41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2532 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 178 aa  356  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  48.15 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  44.95 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  43.69 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  37.9 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  42.98 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  40.17 
 
 		 142 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  40.37 
 
 		 139 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.32 
 
 		 137 aa  88.2  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  37.39 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.45 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  35.11 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  29.36 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  29.31 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  30.93 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  30.93 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.78 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  29.77 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  31.31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.23 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  34.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  29 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 133 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.98 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>