42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1726 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.9 
 
 		 193 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.16 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.82 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  52.63 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  46.46 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  45.87 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  37.68 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.51 
 
 		 166 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.74 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 		 178 aa  80.1  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.04 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  31.19 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  31.19 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33.63 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  32.2 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  34.65 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  30.97 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  24.53 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  29.22 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  34.15 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  29.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  28.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  28.18 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>