40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12421 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  92.91 
 
 
141 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  58.7 
 
 
146 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  58.7 
 
 
146 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  53.57 
 
 
141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  43.48 
 
 
156 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  39.26 
 
 
140 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  39.39 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  37.78 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  39.1 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  33.79 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  33.79 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.82 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  32.39 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  31.11 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  30.63 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.32 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  27.91 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  26.21 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  26.17 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.81 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.44 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.33 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  23.4 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  25.45 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.12 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>