46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_12971 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  95.71 
 
 		 140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  93.57 
 
 		 140 aa  264  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  53.49 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  39.04 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  39.26 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  37.78 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  35.82 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  29.75 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  29.75 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  31.39 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  34.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  39.44 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.97 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  31.62 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  31.62 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  27.73 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  24.3 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  34.88 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  34.88 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  34.88 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>