45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0868 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.39 
 
 		 152 aa  163  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.01 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  48.51 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.82 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.41 
 
 		 193 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  42.75 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  43.52 
 
 		 166 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  32.17 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  31.21 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  35.16 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  30.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  30.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  32.37 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  31.94 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33.7 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  26.92 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.96 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  26.81 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  28.26 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  28.78 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.62 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  35.59 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.9 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  30.23 
 
 		 147 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  27.03 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  27.03 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>