47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02199 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.8 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.51 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.59 
 
 		 193 aa  137  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.62 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.63 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  41.3 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  41.3 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  45.05 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.37 
 
 		 178 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  40.35 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  36.57 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  32.79 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  38.05 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  30 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  31.16 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  34.86 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33.67 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  27.91 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  28.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  30.6 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  27.45 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.61 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  28.97 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  28.04 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.52 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  26.15 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>