50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1314 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  61.87 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  50.41 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  43.84 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.06 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.51 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  40.35 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  37.68 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.16 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  29.29 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  30.17 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  27.46 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  27.46 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  26.39 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  27.54 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  30 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  27.59 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  32.04 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  32.04 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  29.1 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  29.1 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  29.2 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  26.97 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  28.74 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 134 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  26.12 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  25 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 131 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>