30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5003 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 144 aa  290  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  60.42 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  53.64 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  53.64 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  53.64 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  50.43 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.05 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.75 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  31.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  39.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  32.22 
 
 		 147 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  27.38 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  31.71 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  30.39 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1358  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0849787  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  31.71 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  32.35 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.95 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>