17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5112 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  59.05 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  59.05 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  59.05 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.65 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  39.83 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 231 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>