10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6217 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  100 
 
 		 160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.42 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  48.48 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  48.48 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  48.48 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  38.39 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>