19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4539 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4539  cupin 2, barrel  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4626  cupin 2, barrel  100 
 
 		 144 aa  293  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4922  cupin 2, barrel  100 
 
 		 144 aa  293  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.55 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  55.65 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  44.54 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.76 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.78 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  35.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  33.11 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  28.79 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.59 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>