29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04261 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  287  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  51.41 
 
 
140 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  54.26 
 
 
140 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  53.49 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  32.14 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  28.87 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  28.87 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  34.51 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  34.51 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  32.46 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  29.17 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.69 
 
 
166 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  31.47 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.06 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.22 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  26.72 
 
 
148 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  21.74 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  34.72 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  31.65 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 
135 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>