38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1633 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  283  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  61.7 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  35.86 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  35.82 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  33.79 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  32.61 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  31.43 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  31.03 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  33.67 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  26.09 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  26.09 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  37.74 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  30.53 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.46 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  26.5 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  30.36 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  28.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  26.35 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 
231 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  33.66 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>