57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1706 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  26.67 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  28.09 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  27.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  28.97 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  29.41 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  29.09 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  28.04 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  27.84 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  26.67 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.23 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  28.04 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  32.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.18 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  24.8 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  27.97 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.84 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  35.8 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 135 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 135 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  29.76 
 
 		 143 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>