34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2287 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.34 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 		 199 aa  84  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.57 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1549  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  38.78 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  33.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  30 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  29.21 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  26.97 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.04 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1298  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  29.55 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  36.51 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  48.78 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  21.36 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 		 112 aa  42  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.96 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>