14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3286 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 124 aa  243  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1549  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.13 
 
 		 144 aa  159  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.57 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.57 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  27.84 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  35.24 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  25.25 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  25.24 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  21.62 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.86 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>