15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3851 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 143 aa  293  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 398 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  40.82 
 
 		 396 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 311 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.5 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  35.42 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>