50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2388 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  100 
 
 		 389 aa  803    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  42.15 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  40.75 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  41.4 
 
 		 404 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  40.17 
 
 		 408 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  40.29 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  39.88 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  39.88 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  37.9 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  41.18 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.07 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  35.67 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  41.29 
 
 		 658 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  38.15 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  35.67 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  35.09 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  33.14 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  35.09 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  35.09 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  32.84 
 
 		 418 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  32.42 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.39 
 
 		 234 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  26.22 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  24.25 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  24.51 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  31.34 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  30.88 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  30.15 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.53 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 146 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 123 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  36.78 
 
 		 159 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  40.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 170 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 170 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>