96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1526 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  91.27 
 
 		 378 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  87.57 
 
 		 384 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  100 
 
 		 658 aa  1341    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  53.39 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  52.83 
 
 		 404 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  52.02 
 
 		 404 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  49.33 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  49.07 
 
 		 398 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  49.17 
 
 		 405 aa  362  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  43.5 
 
 		 477 aa  337  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  47.14 
 
 		 402 aa  334  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  47.19 
 
 		 418 aa  333  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  46.07 
 
 		 418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  46.07 
 
 		 418 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  46.07 
 
 		 418 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  45.79 
 
 		 418 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  46.13 
 
 		 418 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  45.51 
 
 		 418 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  43.68 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  41.23 
 
 		 407 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  43.67 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  61.57 
 
 		 241 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  41.29 
 
 		 389 aa  231  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  44.5 
 
 		 234 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  48.3 
 
 		 224 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  39.8 
 
 		 238 aa  127  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  32.18 
 
 		 227 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  36.36 
 
 		 225 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  38.95 
 
 		 212 aa  94.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  36.99 
 
 		 215 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  34.64 
 
 		 252 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  34.64 
 
 		 252 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  36.49 
 
 		 264 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  37.23 
 
 		 224 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 347 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.81 
 
 		 250 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  37.31 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  33.52 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  39 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.75 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  38.3 
 
 		 214 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  36.08 
 
 		 234 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  38.3 
 
 		 214 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  37.5 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  36.26 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  36.92 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  36.92 
 
 		 233 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  36.92 
 
 		 233 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  36.7 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  34.5 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  32.22 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  31.43 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.06 
 
 		 240 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  24.8 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  22.57 
 
 		 345 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.24 
 
 		 262 aa  54.7  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  27.12 
 
 		 224 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  30.07 
 
 		 211 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  30.34 
 
 		 211 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  30.34 
 
 		 211 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 146 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.56 
 
 		 222 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  27.78 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.87 
 
 		 259 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  40.28 
 
 		 116 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  28.68 
 
 		 250 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  37.68 
 
 		 255 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  26.82 
 
 		 214 aa  47.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.86 
 
 		 243 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  40.58 
 
 		 239 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  31.17 
 
 		 238 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  32.85 
 
 		 207 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  26.21 
 
 		 215 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  29.22 
 
 		 253 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 111 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  35.06 
 
 		 234 aa  44.3  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  26.18 
 
 		 220 aa  44.3  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.01 
 
 		 231 aa  43.9  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  27.33 
 
 		 386 aa  43.9  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>