50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0371 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  100 
 
 		 404 aa  825    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  95.05 
 
 		 404 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  82.76 
 
 		 408 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  60.37 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  60.37 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  56.51 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  52.02 
 
 		 658 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  50.65 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  52.25 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  49.88 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  49.61 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  49.61 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  49.35 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  49.61 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  49.35 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  50.65 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  50 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  49.1 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  45.85 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  45.63 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  44.53 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  45.43 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  41.4 
 
 		 389 aa  270  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  58.17 
 
 		 234 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  25.6 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  26.45 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  25.49 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 146 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 138 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 141 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  29.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 103 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  30.43 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  27.78 
 
 		 211 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>