52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2322 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  100 
 
 
389 aa  806    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  44.89 
 
 
408 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  43.84 
 
 
398 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  43.84 
 
 
398 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  42.54 
 
 
405 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  44.44 
 
 
404 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  46.82 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  44.48 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  44.81 
 
 
418 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  45.15 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  42.9 
 
 
418 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  43.45 
 
 
418 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  43.45 
 
 
418 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  43.45 
 
 
418 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  43.88 
 
 
418 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  43.88 
 
 
418 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  43.88 
 
 
418 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  40.62 
 
 
389 aa  270  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  43.04 
 
 
378 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  43.67 
 
 
658 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  40.35 
 
 
384 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
407 aa  235  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  40 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.79 
 
 
234 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  27.05 
 
 
347 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  22.29 
 
 
345 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  24.9 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  29.63 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  29.94 
 
 
224 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  28.4 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  28.74 
 
 
211 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  28.14 
 
 
211 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2487  hypothetical protein  31.46 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00410719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
369 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  30.84 
 
 
119 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2202  hypothetical protein  28.09 
 
 
210 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2245  hypothetical protein  28.09 
 
 
210 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0710314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2259  cupin domain-containing protein  28.09 
 
 
210 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2547  hypothetical protein  28.41 
 
 
210 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2468  hypothetical protein  28.09 
 
 
174 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2923  hypothetical protein  26.97 
 
 
210 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.112138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>