112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5027 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  87.93 
 
 
117 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  79.31 
 
 
118 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  73.5 
 
 
117 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  69.83 
 
 
118 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  65.25 
 
 
117 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.41 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  55.65 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52 
 
 
115 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50.53 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.74 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  43 
 
 
113 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  39.81 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.18 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  41.75 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.75 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  38.1 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.45 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  38.1 
 
 
114 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.51 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.51 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.79 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  33.04 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.57 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.66 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.1 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.56 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.56 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  49.25 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  39.56 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.1 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.51 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  49.25 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  34.29 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.31 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.31 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.67 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  37.37 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.45 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  34.51 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.79 
 
 
115 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.51 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.79 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  35.85 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.3 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  32.67 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.67 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.67 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.63 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.87 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  38.24 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  43.48 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  29.57 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  28.7 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.89 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  37.63 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.61 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  43.48 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  30.97 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.63 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  33.65 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.58 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  31.58 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.53 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.06 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.3 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.78 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.28 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  28.16 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  38.24 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.96 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.03 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.32 
 
 
296 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  36.99 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.93 
 
 
240 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  30.21 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.25 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  45.83 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.17 
 
 
227 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.32 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>