80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0053 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 353 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  51.78 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  51.45 
 
 		 353 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  48.25 
 
 		 342 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  49.86 
 
 		 348 aa  361  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  53.01 
 
 		 353 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 345 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 345 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 345 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  47.95 
 
 		 342 aa  360  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  48.36 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  49.42 
 
 		 348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  48.55 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  49.26 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  48.21 
 
 		 364 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  49.4 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  47.92 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  49.7 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  49.55 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  48.51 
 
 		 348 aa  345  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  47.32 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  47.32 
 
 		 348 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  47.23 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  45.78 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.12 
 
 		 350 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  35.86 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  36.47 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  35.86 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  39.05 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  34.39 
 
 		 379 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  35.37 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  36.98 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  36.97 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  37.24 
 
 		 377 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.61 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  33.52 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 373 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.35 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.93 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.11 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  34.08 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  34.08 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  33.76 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  29.97 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  33.76 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  33.76 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  33.92 
 
 		 283 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.92 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  34.87 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  35.63 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  27.27 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 162 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  34.65 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 148 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  28.93 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  31.68 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  28.66 
 
 		 181 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 134 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  26.37 
 
 		 148 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  28.75 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 123 aa  43.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>