19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0677 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  64.97 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  58.8 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  56.48 
 
 		 358 aa  350  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  52.65 
 
 		 318 aa  329  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  43.73 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  47.19 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  24.32 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  27.56 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  30.58 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  28.38 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  28.46 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  28.75 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  31.61 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  31.61 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  31.91 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>