80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4221 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 347 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 347 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  93.95 
 
 		 347 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  91.33 
 
 		 348 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  97.69 
 
 		 347 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  81.18 
 
 		 364 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  80.69 
 
 		 348 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  81.36 
 
 		 348 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  77.78 
 
 		 370 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  73.24 
 
 		 348 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  73.24 
 
 		 348 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  67.65 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  66.86 
 
 		 353 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  65.38 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  61.36 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  61.36 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  61.36 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  61.36 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  61.36 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  58.67 
 
 		 342 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  58.96 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  60.12 
 
 		 364 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  62.94 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  58.82 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  53.85 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  56.6 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  49.25 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.24 
 
 		 350 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  42.31 
 
 		 379 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.26 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  39.64 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  40.48 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.9 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  39.29 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.01 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.41 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  36.07 
 
 		 379 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  37.98 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  37.17 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  40.51 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  39.58 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 372 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.22 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  36.66 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  35.69 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  36.66 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  34.22 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  35.89 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  35.89 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  35.84 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  37.39 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  41.24 
 
 		 283 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  34.49 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  31.9 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  32.15 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.06 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  38.17 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  33.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  27.59 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.61 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 134 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.65 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  31.61 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 123 aa  43.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>