28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2315 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  64.97 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  58.39 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  57.09 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  53.72 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  43.85 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  43.38 
 
 		 295 aa  252  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  24.39 
 
 		 178 aa  53.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  27.67 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  29.66 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  30.08 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  32.82 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  29.25 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.26 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  28.23 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  26.85 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  32 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  32 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  25.55 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 162 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  28.28 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>