64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0679 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  91.06 
 
 		 361 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  91.06 
 
 		 361 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  85.37 
 
 		 361 aa  216  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  85.37 
 
 		 361 aa  216  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  85.37 
 
 		 356 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  48.76 
 
 		 370 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  39.33 
 
 		 331 aa  63.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  60.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 364 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  35 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  27.68 
 
 		 376 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  33.63 
 
 		 348 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  35.45 
 
 		 348 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3192  hypothetical protein  96.3 
 
 		 465 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 365 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  34.34 
 
 		 348 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  34.34 
 
 		 348 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  34.31 
 
 		 364 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 345 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  38.24 
 
 		 353 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  34.94 
 
 		 362 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 363 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  28.68 
 
 		 342 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  31.93 
 
 		 324 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  28.68 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 345 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  28.83 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 350 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  30.26 
 
 		 364 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  30.36 
 
 		 347 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 		 347 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 387 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  34.52 
 
 		 348 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  34 
 
 		 348 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5581  hypothetical protein  40.74 
 
 		 358 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5984  hypothetical protein  40.74 
 
 		 358 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0555874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  33.7 
 
 		 353 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  29.46 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  29.46 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 377 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  30.19 
 
 		 379 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 351 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  33.65 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  32.31 
 
 		 368 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 351 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 367 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 343 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  32.61 
 
 		 348 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.77 
 
 		 370 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 351 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  26.55 
 
 		 370 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  31.17 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 334 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>