75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0167 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  748    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  84.49 
 
 		 367 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  81.84 
 
 		 372 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  80.23 
 
 		 377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  74.44 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.17 
 
 		 363 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.02 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.96 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  34.63 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  36.89 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  35.57 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.32 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  37.78 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  35.68 
 
 		 362 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  36.65 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  36.47 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  34.11 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  34.11 
 
 		 347 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  34.11 
 
 		 347 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  36.31 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  34.88 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  34.88 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  37.22 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  34.74 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  35.4 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  35.24 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  36.65 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  35.63 
 
 		 348 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  35.63 
 
 		 348 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  35.13 
 
 		 353 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  35.67 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  35.06 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  34.94 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  32.87 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  33.9 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  33.81 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  33.81 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  31.65 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  30.81 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  33.23 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  33.22 
 
 		 283 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  30.79 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  30.64 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.7 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  34.17 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 181 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 134 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  29.31 
 
 		 178 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  29.63 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.84 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  29.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  28.16 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>