68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3702 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  700    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  74.49 
 
 		 351 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  75.29 
 
 		 351 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  72.73 
 
 		 351 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  72.51 
 
 		 334 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  55.07 
 
 		 343 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  51.94 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  39.17 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  36.5 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  38.64 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  36.73 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  36.2 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  40.18 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  39.88 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  39.88 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  39.29 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  38.39 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  35 
 
 		 370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  35.87 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.83 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  37.98 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  38.07 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  39.05 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  36.83 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  38.1 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  35.61 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  35.61 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  34.53 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.87 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  34.49 
 
 		 344 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  34.52 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  34.49 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  35.48 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.33 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.22 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  35.55 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  33.53 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.03 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  34.58 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  33.24 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  33.53 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  34.08 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  33.97 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  33.97 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  35.02 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  31.56 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.91 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 181 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 134 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  26.97 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>