82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0981 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 348 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  76.95 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  58.72 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  57.01 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  58.53 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  57.77 
 
 		 348 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  57.48 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  56.64 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  57.18 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  52.35 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  52.35 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  56.6 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  56.6 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  56.09 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  55 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  55 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  56.6 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  52.38 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  55.36 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  55.07 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  55.88 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  49.7 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  43.5 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.45 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 370 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  38.53 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  39.76 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  37.28 
 
 		 387 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  37.54 
 
 		 376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  36.39 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  38.07 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  35 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  34.73 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  33.62 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  35.59 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.09 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  34.22 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  33.43 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  34.46 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  33.24 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  35.53 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.53 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  32.16 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32.54 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  32.24 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.14 
 
 		 283 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  29.39 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  26.15 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  23.69 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  27.97 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  31.78 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.35 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 162 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 123 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  38 
 
 		 159 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  29.69 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 124 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>